二、50号公告适用的抵扣凭证范围包括“增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书和公路内河货物运输业统一发票”，因“公路内河货物运输业统一发票”这一票种在营改增后已不存在，该条款由36号公告废止，适用范围变为“增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书和机动车销售统一发票”。
三、为适应审核权限下放的规定，36号公告对50号公告的附件《逾期增值税扣税凭证抵扣管理办法》也做了相应修改：第四条第二款修改为“主管税务机关核实无误后，应向上级税务机关上报，并将增值税扣税凭证逾期情况说明、第三方证明或说明、逾期增值税扣税凭证电子信息、逾期增值税扣税凭证复印件逐级上报至省国税局”；第五条修改为：“省国税局对上报的资料进行案头复核，并对逾期增值税扣税凭证信息进行认证、稽核比对，对资料符合条件、稽核比对结果相符的，允许纳税人继续抵扣逾期增值税扣税凭证上所注明或计算的税额”。
纳税人需要注意，除了上述改动之外，36号公告未对各省国税局审核逾期增值税扣税凭证作出进一步的具体要求，而是原则性的规定“各省国税局应在修改后的国家税务总局公告2011年第50号附件《逾期增值税扣税凭证抵扣管理办法》（以下简称《管理办法》）相关规定基础上，按照进一步深化税务系统“放管服”改革、优化税收环境的要求，以方便纳税人、利于税收管理为原则，进一步细化流程、明确时限、简化资料、改进服务”。因此纳税人需关注主管税务机关所属省级国税局的相关规范性文件。